More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1654 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1654  ROK  100 
 
 		 420 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  59.9 
 
 		 416 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  59.67 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  60.1 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  59.62 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  60.38 
 
 		 416 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  59.57 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  59.81 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  59.57 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  59.81 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  59.81 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  37.91 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1899  ROK  34.23 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  35.71 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  34.58 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  33.25 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  32.68 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  34.18 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  35.71 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  32.2 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_1372  ROK  31.23 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  33.59 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  29.06 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  32.08 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  31.66 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  33 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  30.95 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  33.05 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  32.2 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  33.41 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  33.51 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  31.28 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  33.61 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  31.48 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  32.02 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  29.59 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  31.58 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
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NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  34.81 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.58 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.47 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  30.58 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.19 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  30.86 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.84 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.88 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  31.18 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
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NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  31.27 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.57 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.91 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.91 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25.07 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.4 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  30.11 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  33.33 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.09 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  30.64 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.47 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  26.63 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  26.25 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  25.26 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.61 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.5 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  24.73 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.96 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  28.61 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.75 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.88 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.88 
 
 		 399 aa  96.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  34.73 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.97 
 
 		 754 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  29.91 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.22 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  27.62 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  25.39 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.44 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.41 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  30.04 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.71 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  26.23 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.93 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.83 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.57 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.72 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  28.62 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.2 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.56 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.68 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  25.06 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  25.71 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  27.32 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  25.94 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  26.48 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
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NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  25.71 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.1 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  26 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  27.48 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  26.18 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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