More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 403 aa  776    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  46.89 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  36.63 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  36.34 
 
 		 417 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  31.66 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.67 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.94 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  34.17 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.47 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.51 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  35.13 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  31.33 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.07 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.53 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  31.51 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  34.41 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.74 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.09 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.07 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.99 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.41 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  33.68 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  33.33 
 
 		 754 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.68 
 
 		 503 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  28.99 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.61 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  31.45 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.02 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.18 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.53 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.72 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.11 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  31.9 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.51 
 
 		 352 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.72 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.97 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.41 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.43 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.52 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  33.42 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  34.25 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.63 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.07 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.05 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.53 
 
 		 395 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  30.27 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.18 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.47 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.26 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  34.57 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  34.13 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  29.61 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.91 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  30.34 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.05 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.19 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  30.79 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.67 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  34.06 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  22.68 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.78 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.06 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.21 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  28.87 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.42 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.28 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.86 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.61 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  28.75 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.36 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  31.65 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.51 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  32.13 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.39 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.67 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.1 
 
 		 320 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.94 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.53 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  25.07 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.18 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.67 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  23.5 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.61 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  28.78 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  27.32 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.61 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.09 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.61 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.25 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.16 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.98 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  31.91 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.04 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  28.13 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  28.76 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.27 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  27.37 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  26.68 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  32.89 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>