More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
386 aa  759    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  35.58 
 
 
386 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  35.28 
 
 
393 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  35.5 
 
 
390 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  36.01 
 
 
389 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  34.81 
 
 
400 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  34.33 
 
 
380 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  33.13 
 
 
405 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2213  ROK family protein  29.55 
 
 
423 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915289  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  32.73 
 
 
404 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.9 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.91 
 
 
408 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  29.78 
 
 
434 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.86 
 
 
417 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
404 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.02 
 
 
407 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.04 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  32.92 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.27 
 
 
405 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.27 
 
 
414 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  27.62 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  27.33 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.71 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.2 
 
 
417 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  27.1 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  27.1 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.17 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  32.63 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  27.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  27.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  27.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  27.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  27.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.68 
 
 
410 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  27.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  27.44 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  27.44 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  27.44 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  26.79 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  27.44 
 
 
406 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  27.62 
 
 
405 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  27.44 
 
 
406 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  27.44 
 
 
406 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  23.6 
 
 
388 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.86 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.39 
 
 
396 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  27.13 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.44 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.68 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.17 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  27.14 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.86 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  27.95 
 
 
405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.84 
 
 
395 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07440  transcriptional regulator/sugar kinase  30.16 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  27.7 
 
 
425 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.07 
 
 
391 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  30 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.23 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  30.68 
 
 
403 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.45 
 
 
386 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.72 
 
 
428 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.06 
 
 
402 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  26.68 
 
 
417 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1484  NagC family Transcriptional regulator  26.5 
 
 
402 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.511985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.09 
 
 
401 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  32.87 
 
 
429 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.97 
 
 
379 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.87 
 
 
410 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  29.36 
 
 
379 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.66 
 
 
429 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  25.59 
 
 
396 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.7 
 
 
390 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.78 
 
 
414 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.41 
 
 
398 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.6 
 
 
425 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.66 
 
 
396 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.18 
 
 
392 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.61 
 
 
409 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  29.86 
 
 
401 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.9 
 
 
389 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.01 
 
 
409 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  32.77 
 
 
393 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.53 
 
 
315 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  31.01 
 
 
417 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  31.03 
 
 
390 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.18 
 
 
382 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.06 
 
 
425 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.76 
 
 
396 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  34.15 
 
 
306 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  33.02 
 
 
466 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.51 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.17 
 
 
398 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  26.44 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  33.61 
 
 
306 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.84 
 
 
319 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.89 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.94 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  32.62 
 
 
307 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  30.94 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
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