More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2607 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  100 
 
 		 404 aa  813    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  77.83 
 
 		 414 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  75.75 
 
 		 409 aa  624  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  67.84 
 
 		 407 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  69.02 
 
 		 410 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  58.88 
 
 		 422 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  51.39 
 
 		 416 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  53.38 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  52.39 
 
 		 413 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  41.22 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  38.79 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  38.79 
 
 		 409 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  38.38 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  38.04 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  40.15 
 
 		 410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  39.33 
 
 		 409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  39.79 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  39.06 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  35.51 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  40.93 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  40.55 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  35.92 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  35.61 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  36.51 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  34.45 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  34.45 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  34.54 
 
 		 415 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  34.28 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  34.7 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  34.54 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  34.54 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  34.02 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  34.45 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  34.28 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  32.68 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  29.21 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  32 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.67 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  29.44 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  32.84 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  33.05 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  31.92 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.4 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  30.71 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.19 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  29.8 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  29.04 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  31.25 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.38 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  28.11 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.05 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.18 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  26.17 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  25.62 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.28 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.08 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  25.54 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.08 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.34 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.34 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  24.53 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  26.22 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  31.22 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  26.41 
 
 		 754 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  24.93 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  25.61 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  27.37 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.87 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  27.07 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  25.49 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.84 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  22.74 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  22.92 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.32 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  31.27 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  27.61 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  26.44 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  27.73 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  24.4 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  27.66 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  22.34 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  27.34 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.96 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.3 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.8 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  24.19 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.44 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  28.81 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  32.69 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.67 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  24.65 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  23.08 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  27.39 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  25.89 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  27.11 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  24.8 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.63 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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