More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1656 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  100 
 
 		 416 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  79.81 
 
 		 416 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  80.53 
 
 		 415 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  81.25 
 
 		 415 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  95.67 
 
 		 416 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  81.01 
 
 		 415 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  81.49 
 
 		 415 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  81.01 
 
 		 415 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  81.49 
 
 		 415 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  99.76 
 
 		 416 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  100 
 
 		 416 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  59.67 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  35.98 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  34.45 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  33.59 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  34.45 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  33.93 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  33.42 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  35.09 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  31.88 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  32.12 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  35.14 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  34.02 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  32.45 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  31.96 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  32.93 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  32.47 
 
 		 416 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  31.27 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  31.81 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  33.51 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.51 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  31.87 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  32.73 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  30.77 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  30.81 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  33.08 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  31.3 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  26.8 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  31.85 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  31.57 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  30.33 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.55 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  30.08 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  26.58 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.19 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.86 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  29.84 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  29.29 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.38 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.83 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  28.04 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  29.73 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.12 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  31.72 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27.51 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27.51 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  31.28 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25.87 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.08 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.48 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.67 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.9 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.97 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  26.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  25.13 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.31 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.61 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.39 
 
 		 754 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  27.55 
 
 		 383 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  30.84 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  29.49 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  26.32 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  25.87 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  26.93 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.08 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  25.53 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.41 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  26.94 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.88 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  33.19 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.41 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.1 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.13 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.73 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.45 
 
 		 386 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.25 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  26.79 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  27.27 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.53 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  29.69 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  28.69 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  28.79 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.1 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  27.72 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  27.62 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.08 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.94 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  29.55 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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