More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0149 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  100 
 
 
418 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  57.86 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  42.13 
 
 
412 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  43.54 
 
 
412 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  41.21 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  36.07 
 
 
417 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  30.33 
 
 
404 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  33.82 
 
 
417 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  33.53 
 
 
415 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  31.36 
 
 
421 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  32.65 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  32.94 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  32.65 
 
 
415 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  32.65 
 
 
415 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  32.65 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  33.14 
 
 
416 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  32.26 
 
 
416 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.51 
 
 
416 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.51 
 
 
416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.51 
 
 
416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  33.08 
 
 
391 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  29.97 
 
 
410 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  32.1 
 
 
400 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  31.28 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  31.66 
 
 
400 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  30.17 
 
 
439 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  30.85 
 
 
409 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  28.78 
 
 
416 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  30.41 
 
 
415 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  31.46 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  30 
 
 
409 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  33.53 
 
 
367 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  29.44 
 
 
404 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  28.79 
 
 
406 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  34.11 
 
 
420 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  29.89 
 
 
410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  28.22 
 
 
413 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  30.65 
 
 
409 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  30.54 
 
 
370 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  30.54 
 
 
370 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  28.31 
 
 
413 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.95 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  30.3 
 
 
401 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  28.43 
 
 
422 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  27.64 
 
 
411 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  28.97 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  26.41 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  27.53 
 
 
421 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  30.1 
 
 
407 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  30.1 
 
 
407 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  26.73 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  27.17 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.3 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.62 
 
 
397 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  31.02 
 
 
382 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.55 
 
 
389 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  29.67 
 
 
398 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  36.65 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  35.65 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  28.21 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  30.69 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.47 
 
 
382 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  27.87 
 
 
375 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.52 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.98 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.33 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  31.07 
 
 
367 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.5 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  33.15 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.43 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.925334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.4 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.17 
 
 
399 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.84 
 
 
398 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  27.96 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.74 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  32.46 
 
 
417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  33.08 
 
 
473 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.96 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  28.9 
 
 
414 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.9 
 
 
416 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  28.26 
 
 
380 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.86 
 
 
405 aa  106  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  32.38 
 
 
382 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.75 
 
 
434 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.17 
 
 
414 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.88 
 
 
387 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.21 
 
 
406 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  32.73 
 
 
424 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  26.05 
 
 
387 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.07 
 
 
400 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.73 
 
 
389 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.67 
 
 
393 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.37 
 
 
405 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.07 
 
 
408 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  33.06 
 
 
368 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.05 
 
 
410 aa  99.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.87 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.12 
 
 
503 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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