187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4697 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  89.01 
 
 		 379 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  100 
 
 		 379 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7332  Transcriptional regulator/sugar kinase  34.28 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.39 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.72 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  25.26 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  27.86 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.51 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  24.67 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  27.13 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  26.33 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.02 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  23.72 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  26.17 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  24.46 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  26.18 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  25.46 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  25.98 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  24.6 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  26.6 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  24.61 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  30.04 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  26.95 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  26.36 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  27.03 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.78 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  27.69 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  23.33 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  23.91 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  24.93 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  26.3 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  26.38 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  24.27 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  24.27 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.69 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  26.41 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  26.41 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  24.47 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  24.12 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  22.09 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  27.82 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  24.04 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  22.76 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  26.12 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  24.28 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  23.51 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  24.6 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  24.68 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  22.25 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  26.48 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  24.29 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  22.14 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  24.64 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  24.64 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  25.86 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  24.93 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  23.99 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  30.4 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  22.13 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  24.36 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  23.99 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  25.21 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  21.1 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  42 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.27 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  25.64 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  24.53 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  22.31 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  22.81 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  21.03 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  26.45 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  19.84 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  27.59 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  19.84 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  19.84 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  24.21 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  21.59 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  25.44 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  38.18 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  20.83 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  25.82 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  24.26 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  37.27 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.93 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  26.83 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  20 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  23.69 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  24.63 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  26.85 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  27 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  23.61 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
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NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  25.83 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.85 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  35.64 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  20.58 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  25.08 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  27.43 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  25.06 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
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