More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1583 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  100 
 
 		 387 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  60.16 
 
 		 388 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  43.06 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  40.75 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  38.03 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  38.99 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  35.04 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  37.35 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  34.11 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.09 
 
 		 401 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.89 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.38 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.89 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  36.41 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  32.06 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.31 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.77 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.46 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.17 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.13 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  33.8 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  29.92 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  32.91 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  24.18 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  30.89 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.9 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  30.73 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  32.47 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.84 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.57 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.25 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.24 
 
 		 389 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.47 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  22.62 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.61 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  28.07 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  21.78 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.79 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.11 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  29.34 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.92 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.93 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.08 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.79 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.76 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  30.46 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.1 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  28.68 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.81 
 
 		 420 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  23.85 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.58 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.59 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  28.46 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  29.89 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  31.46 
 
 		 302 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.24 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.24 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.99 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.19 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  26.6 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.25 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.76 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  28.16 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.06 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.25 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.87 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.18 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  32.07 
 
 		 434 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  29.74 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  28.21 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  29.84 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  27.97 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.9 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.98 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.38 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.87 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.31 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  25.39 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.23 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  31.54 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  21.7 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  28.49 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.01 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.85 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.53 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.26 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  29.7 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.7 
 
 		 396 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.18 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.65 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.23 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.25 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.1 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  21.92 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.75 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  21.99 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.19 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.38 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  29.72 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>