More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3560 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  100 
 
 		 374 aa  740    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  61.29 
 
 		 382 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  61.29 
 
 		 377 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  41.46 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  35.06 
 
 		 400 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.79 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.8 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  29.35 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.32 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.09 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.1 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.03 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.79 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.49 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  31.82 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  30.62 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.2 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.82 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.53 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.68 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.69 
 
 		 401 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.99 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  26.84 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.21 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  26.3 
 
 		 301 aa  97.1  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.77 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.69 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  28.2 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.68 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.62 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.25 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.9 
 
 		 503 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  26.84 
 
 		 399 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.69 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.82 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  27.1 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  23.86 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  29.84 
 
 		 436 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  25.4 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  30.77 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
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NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  26.15 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.7 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.19 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  27.6 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.07 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  28.77 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.33 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  26.84 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.65 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.95 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  27.32 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  30.43 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.47 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
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NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  25.31 
 
 		 299 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  25.24 
 
 		 298 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  29.62 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.6 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05680  transcriptional regulator/sugar kinase  28.3 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.244625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.23 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  31.44 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  30.06 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  30.43 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.61 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.53 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.96 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  26.14 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.6 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  26.14 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.39 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.34 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.16 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  28.06 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  31.72 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  28.53 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  20.4 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  26.98 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  27.76 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  27.02 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
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NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  31.17 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
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NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  23.08 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.82 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  29.22 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  24.89 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
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NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  29.49 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
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NC_011988  Avi_5336  glucokinase  30.41 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.13 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  26.45 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.2 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  23.7 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  24.68 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  28.72 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.09 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  29.94 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.7 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.19 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  25.98 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  26.89 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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