More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2620 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  100 
 
 		 379 aa  736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  42.05 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  41.78 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  41.46 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  34.72 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.78 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  31.93 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  33.51 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  31 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  32.34 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  30.89 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.07 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.82 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  32.81 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.43 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.44 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.81 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.08 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  32.02 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.54 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  32.14 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.57 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  30.03 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.85 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  32.74 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.49 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  30.61 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.23 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.56 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.53 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  30.14 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.25 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  32.25 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.26 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  23.86 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.06 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  29.3 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  25.27 
 
 		 276 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.55 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.72 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  28.39 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.27 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  26.99 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  29.88 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  28.1 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  26.84 
 
 		 311 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  30.75 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
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NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  29.29 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.94 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  31.75 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.37 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.75 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.58 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.2 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.85 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.85 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  30.41 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.44 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.37 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.51 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.91 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  25.77 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.02 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  29.33 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.41 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.6 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  30.69 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.99 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  27.63 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.77 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.56 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.48 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.55 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.7 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.67 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  22.95 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.28 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.92 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.1 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
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NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  24.59 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  24.93 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  30.85 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  29.08 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  27.04 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  29.33 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.28 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.82 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  22.98 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  27.44 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  29.21 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.27 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  23.22 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  29.39 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.02 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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