More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5336 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  100 
 
 		 478 aa  972    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2252  putative serine protease  44.12 
 
 		 198 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.58 
 
 		 300 aa  161  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1951  putative kinase  40.94 
 
 		 177 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2247  putative kinase  40.94 
 
 		 177 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.69 
 
 		 342 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.64 
 
 		 315 aa  136  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.16 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.28 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  30.41 
 
 		 291 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  33.58 
 
 		 299 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  32.05 
 
 		 317 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.2 
 
 		 321 aa  123  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.55 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.8 
 
 		 317 aa  120  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.34 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  34.12 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.09 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  34.12 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  34.12 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.98 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.55 
 
 		 316 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.61 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.35 
 
 		 314 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.35 
 
 		 314 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  34.39 
 
 		 302 aa  116  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  32.11 
 
 		 299 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.57 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.23 
 
 		 297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.91 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  30.82 
 
 		 313 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.77 
 
 		 327 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.03 
 
 		 313 aa  113  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  33.44 
 
 		 327 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.6 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  31.63 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.25 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.32 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  35.02 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  31.53 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.43 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  29.67 
 
 		 314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.12 
 
 		 327 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.12 
 
 		 327 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.68 
 
 		 361 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.76 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  32.55 
 
 		 302 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.71 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  32.55 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.79 
 
 		 327 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.13 
 
 		 297 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.13 
 
 		 297 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.83 
 
 		 320 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  32.55 
 
 		 302 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  32.55 
 
 		 331 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  32.55 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  32.55 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  32.27 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  32.35 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  32.94 
 
 		 313 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  32.55 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  33.33 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  32.55 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  30.59 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.63 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  31.63 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  31.76 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  34.51 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.39 
 
 		 315 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.71 
 
 		 322 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  31.09 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  33.78 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  31.63 
 
 		 302 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.82 
 
 		 315 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.2 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  31.63 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  34.7 
 
 		 321 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  31.91 
 
 		 303 aa  106  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  29.84 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  32.02 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.43 
 
 		 303 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.33 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  30.23 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  32.47 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  30.72 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.81 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  30.72 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  31.37 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  32.43 
 
 		 312 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.62 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>