More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1654 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  100 
 
 
406 aa  766    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  37.5 
 
 
391 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  36.12 
 
 
387 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  37.17 
 
 
388 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  34.72 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  38.3 
 
 
374 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  36.1 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  37.37 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.43 
 
 
387 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  30.1 
 
 
393 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.92 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  32.38 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.83 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.5 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  32.2 
 
 
393 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.56 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.9 
 
 
392 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.03 
 
 
396 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  34.84 
 
 
418 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.08 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  30.36 
 
 
403 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  33.16 
 
 
392 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  29.43 
 
 
417 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.41 
 
 
402 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  28.53 
 
 
429 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  31.16 
 
 
400 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  31.46 
 
 
395 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  28.27 
 
 
404 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  31.61 
 
 
420 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.61 
 
 
422 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.71 
 
 
401 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  29.5 
 
 
393 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.67 
 
 
390 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.81 
 
 
503 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.2 
 
 
418 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  31.67 
 
 
386 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.91 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  30.63 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  37.96 
 
 
428 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  31.88 
 
 
318 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.9 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.38 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.2 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  31.23 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  31.45 
 
 
402 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  28.03 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.51 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  26.47 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.49 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  31.04 
 
 
404 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.35 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.23 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  31.61 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.21 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.36 
 
 
303 aa  93.2  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.22 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  28.67 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.27 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.09 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.93 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.64 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.15 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.57 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.57 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.06 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
304 aa  90.1  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  31.72 
 
 
312 aa  90.1  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  29.38 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  21.69 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.77 
 
 
378 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.04 
 
 
389 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.38 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.88 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  24.88 
 
 
399 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  22.31 
 
 
397 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  27.81 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.99 
 
 
374 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.77 
 
 
404 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  24.28 
 
 
386 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  26.6 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  31.49 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  29.91 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  29.41 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  28.91 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  26.96 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.1 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.85 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  29.95 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  30.61 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  31.55 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.45 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  21.35 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.14 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  26.22 
 
 
406 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
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