More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0207 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  603  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  39.94 
 
 
305 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3734  ROK family protein  39.8 
 
 
331 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258087  decreased coverage  0.00194225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1048  ROK family protein  39.02 
 
 
361 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.35 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.35 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.13 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.5 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.23 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.59 
 
 
352 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.56 
 
 
312 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.25 
 
 
320 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  30.82 
 
 
317 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.02 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  32.4 
 
 
478 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  29.71 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.33 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.33 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.38 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.82 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.33 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  31.15 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.12 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  31.35 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  33.88 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.19 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.13 
 
 
327 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.25 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  33.11 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.2 
 
 
405 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.57 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  29.43 
 
 
322 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.77 
 
 
315 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  29.37 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  29.63 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.48 
 
 
408 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.25 
 
 
385 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.94 
 
 
393 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.03 
 
 
401 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.08 
 
 
328 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.43 
 
 
318 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.72 
 
 
313 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  29.56 
 
 
323 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  33.84 
 
 
326 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.46 
 
 
402 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  29.23 
 
 
322 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.25 
 
 
300 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  31.68 
 
 
315 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  31.16 
 
 
307 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.29 
 
 
303 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.19 
 
 
422 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.17 
 
 
305 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  31.19 
 
 
323 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.38 
 
 
315 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  32.86 
 
 
323 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.01 
 
 
306 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  32.89 
 
 
296 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.89 
 
 
406 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  32.2 
 
 
340 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  32.5 
 
 
318 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  30.94 
 
 
393 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.26 
 
 
410 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  27.36 
 
 
308 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  30.62 
 
 
298 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.77 
 
 
392 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.84 
 
 
325 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  32.78 
 
 
300 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.63 
 
 
393 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.82 
 
 
405 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  32.2 
 
 
332 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31.94 
 
 
429 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.66 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  31.2 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  27.31 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.11 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.63 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  27.64 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.33 
 
 
405 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.27 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  33.1 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.95 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  29.71 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  32.32 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.52 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.46 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.39 
 
 
391 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  29.33 
 
 
434 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  26.71 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  26.71 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  26.71 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  26.71 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  26.71 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  26.71 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>