More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0562 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  100 
 
 		 312 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  39.11 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  39.78 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  39.35 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  39.71 
 
 		 280 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  39.71 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  37.4 
 
 		 276 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.37 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  28.9 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.16 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  28.94 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.22 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.8 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.8 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.29 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  28.9 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  25.68 
 
 		 302 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.12 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.12 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.03 
 
 		 322 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  30.45 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.64 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  29.71 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.92 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.56 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.44 
 
 		 399 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  29.47 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  27.91 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  27.02 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  31.12 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.38 
 
 		 395 aa  96.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  30.13 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.57 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  29.44 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  28.47 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  30.14 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  30.84 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  27.27 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  25.83 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.12 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.92 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  29.29 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  26.46 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  24.03 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  25.77 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.46 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.94 
 
 		 398 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  29.31 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.83 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.69 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  29.66 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.24 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.57 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  27.33 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  26.09 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  28.99 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.54 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  28.95 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  28.46 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  24.14 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  27.44 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.57 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  27.41 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.51 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.14 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  26.55 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  26.8 
 
 		 422 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.74 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.78 
 
 		 406 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  28.37 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  26.87 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.25 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  24.44 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  26.71 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  27.38 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  26.34 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.93 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  27.89 
 
 		 392 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  25 
 
 		 396 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.99 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  26.2 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  26.96 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  25.27 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  26.2 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  26.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.84 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  25.58 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.71 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  28.3 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.26 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>