More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0661 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  100 
 
 
321 aa  628  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  61.46 
 
 
317 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8557  glucose kinase  51.06 
 
 
376 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  48.01 
 
 
306 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  46.08 
 
 
307 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  46.34 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  46.5 
 
 
302 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  46.5 
 
 
302 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3653  glucokinase  45.18 
 
 
374 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10663  sugar kinase  48.95 
 
 
302 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.97302e-41  normal  0.432322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  48.84 
 
 
304 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  40.19 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  44.59 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7000  ROK family protein  49.48 
 
 
308 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  40.91 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4996  glucose kinase  47.02 
 
 
313 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  39.22 
 
 
307 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.48 
 
 
315 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.48 
 
 
315 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.01 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.33 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.33 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.58 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.65 
 
 
327 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.01 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.63 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.01 
 
 
334 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  38.39 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.62 
 
 
352 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  34.06 
 
 
322 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  35.99 
 
 
336 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.87 
 
 
315 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.14 
 
 
308 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.69 
 
 
300 aa  135  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.12 
 
 
316 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.17 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  34.7 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  33.12 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 
395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.92 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  32.91 
 
 
320 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.33 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  30.84 
 
 
318 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.4 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.55 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  33.33 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  33.64 
 
 
443 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.07 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  36.22 
 
 
340 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.65 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.65 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.06 
 
 
317 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.87 
 
 
342 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  30.72 
 
 
311 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.77 
 
 
332 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  32.18 
 
 
316 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.13 
 
 
298 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.55 
 
 
319 aa  122  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  35.48 
 
 
392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.89 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.02 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  31.85 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.9 
 
 
303 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  33.23 
 
 
395 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.05 
 
 
389 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  35.78 
 
 
389 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  32.7 
 
 
420 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  37.1 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  32.46 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  29.64 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  33.23 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.41 
 
 
402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.23 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  35 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  34.85 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  30.28 
 
 
332 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.77 
 
 
297 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.17 
 
 
323 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  34 
 
 
302 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  31.19 
 
 
319 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  32.68 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  36.54 
 
 
363 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  35.12 
 
 
302 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.3 
 
 
314 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.61 
 
 
406 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.23 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  33.67 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  32.42 
 
 
395 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  31.19 
 
 
427 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32.34 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32.34 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.58 
 
 
410 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  38.2 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>