More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1397 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  98.57 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  97.86 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  98.55 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  39.71 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  33.82 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  31.92 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.58 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.23 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  30.03 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.41 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.01 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.87 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  26.71 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.37 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  25.27 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  29.84 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.39 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.84 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.84 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.84 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  31.88 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.84 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.93 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.84 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.58 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  26.83 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.99 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.14 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.07 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.07 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.24 
 
 		 302 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.76 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  27.15 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  28.76 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.54 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.84 
 
 		 420 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.52 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  26.94 
 
 		 384 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.65 
 
 		 312 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  27.15 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.49 
 
 		 397 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  28.34 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.64 
 
 		 347 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  27.15 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.64 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  28.24 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  28.75 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  27.15 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  26.82 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  26.82 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  24.83 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  24.83 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  27.06 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  26.82 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  26.82 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  24.83 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  30.5 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  26.16 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.53 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.8 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  29.47 
 
 		 336 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.48 
 
 		 304 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.2 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.35 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  26.97 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  26.94 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  29.93 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  27.18 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  28.81 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.72 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.72 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  30.99 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.43 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  24.48 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  24.13 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  27.27 
 
 		 316 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  29.57 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  27.55 
 
 		 307 aa  89  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  25.27 
 
 		 429 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  28.38 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.89 
 
 		 395 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  24.74 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  25.73 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  26.4 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  25.35 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  28.43 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  24.76 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  26.58 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  24.48 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.96 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  25.5 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  25.5 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  29.77 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  28.28 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  26.52 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.33 
 
 		 410 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  25.5 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  25.5 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.45 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>