More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1875 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  42.14 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5156  ROK family protein  39.8 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00561428  normal  0.212192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.68 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  31.45 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  32.41 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.52 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  29.9 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.81 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.09 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.47 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.46 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.78 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.91 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.91 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  31.42 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.74 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  29.87 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.56 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.21 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  29.03 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  30.51 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.16 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  26.83 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  30.63 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  29.41 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.1 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  28.67 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  28.21 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  30.39 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  26.46 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.25 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  30.7 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25.77 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  26.42 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.38 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  27.96 
 
 		 278 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.8 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  28.53 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.71 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.71 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  27.8 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.91 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  27.84 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  30.03 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.27 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  27.52 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  27.87 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.43 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0225  glucokinase, putative  29.01 
 
 		 329 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  29.63 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  25.24 
 
 		 332 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  28.43 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  27.97 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  28.25 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  30.31 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  28.21 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  28.34 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  28.48 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.01 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  28.85 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  29.19 
 
 		 325 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  27.48 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  30.25 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  26.01 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  27.86 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.1 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.8 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.69 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.8 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.19 
 
 		 404 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  28.37 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  28.14 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  30.34 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  28.53 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  27.55 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.94 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.8 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  31.41 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  29.43 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  26 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  27 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  26.94 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  27.24 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  26.94 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  31.86 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  24.33 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  25.41 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.28 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  23.86 
 
 		 395 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  27.47 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  26.53 
 
 		 280 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  29.52 
 
 		 361 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  27.62 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1639  ROK family glucokinase  33.03 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.352647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1605  ROK family glucokinase  33.03 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  25 
 
 		 408 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.28 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  30.09 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  29.13 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>