More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1636 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  35.1 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  34.53 
 
 
292 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  33.99 
 
 
292 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  34.31 
 
 
292 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  33.99 
 
 
292 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  36.66 
 
 
298 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  33.66 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  33.88 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  33.99 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  33.89 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  37.5 
 
 
311 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  33.55 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  34.63 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  38.1 
 
 
303 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  32.23 
 
 
292 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  33.11 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 
293 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 
293 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 
293 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 
293 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  31.72 
 
 
313 aa  148  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  35.48 
 
 
297 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  35.48 
 
 
297 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  29.14 
 
 
314 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  34.07 
 
 
302 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  30.49 
 
 
297 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  29.04 
 
 
312 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  35.1 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  29.51 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  31.06 
 
 
295 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  32.17 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.35 
 
 
352 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.21 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.38 
 
 
323 aa  136  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.34 
 
 
313 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  30.8 
 
 
289 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  30.03 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.95 
 
 
299 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.91 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.56 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  27.3 
 
 
325 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  31.46 
 
 
297 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.71 
 
 
315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.71 
 
 
315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  28.93 
 
 
314 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.43 
 
 
303 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.43 
 
 
303 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  28.43 
 
 
303 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.43 
 
 
303 aa  122  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.43 
 
 
303 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.43 
 
 
303 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.48 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.61 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.71 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  30.06 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  30.74 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  28.93 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  28.39 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.08 
 
 
317 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  30.12 
 
 
332 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  29.58 
 
 
318 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  29.21 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.27 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  25.93 
 
 
393 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.4 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  29.34 
 
 
290 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  27.02 
 
 
327 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  29.11 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.75 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.17 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  29.1 
 
 
315 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  29.25 
 
 
313 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  25.56 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.69 
 
 
325 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  29.34 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  27.57 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  25.56 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  27.9 
 
 
327 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.9 
 
 
327 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  28.29 
 
 
326 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  27.9 
 
 
327 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  28.53 
 
 
335 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  26.23 
 
 
306 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.62 
 
 
306 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  30.28 
 
 
323 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  30.7 
 
 
314 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  28.39 
 
 
314 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  27.59 
 
 
327 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.36 
 
 
322 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  27.67 
 
 
316 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  29.65 
 
 
313 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  26.23 
 
 
302 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>