More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2605 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  31.46 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  31.65 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  29.43 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.64 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  30 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  23.92 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  31.06 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  29.64 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  23.2 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  27.76 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  27.76 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  31.89 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  22.9 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  28.24 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  29.69 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  29.48 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  29.35 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  22.56 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  21.5 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  24.34 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  21.28 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  24.83 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  25.96 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  23.49 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  20.61 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  23.36 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0921  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  25.28 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  21.71 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  22.51 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  29.1 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  23.83 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.85 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.2 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  23.66 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  25.08 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  22.89 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  23.58 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  23.58 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  23.2 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.2 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.94 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.78 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.2 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.2 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  21.38 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.2 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.26 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.13 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  27.51 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.34 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  24.66 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  20.53 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.38 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.94 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.92 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  26.54 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  25.16 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  26.94 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  24.18 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  21.65 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  23.1 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  22.48 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  24.91 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  23.64 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  26.6 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  27.47 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  26.6 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.93 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  26.6 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  22.38 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  20.5 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  26.6 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  26.25 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.1 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  24.61 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  19.66 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  23.78 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  23.68 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  26.71 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  26.71 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  24.35 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  21.69 
 
 		 478 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  24.23 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  31.88 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  23.85 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2599  N-acetylglucosamine kinase  24.35 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  20.54 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  24.11 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  21.19 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  21.26 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.19 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.9 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>