More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2007 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  99.67 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  99.67 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  99.67 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  99.67 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1335  N-acetyl-D-glucosamine kinase  93.07 
 
 		 303 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0173083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  93.07 
 
 		 303 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  93.07 
 
 		 303 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2148  N-acetyl-D-glucosamine kinase  92.74 
 
 		 303 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  hitchhiker  0.000723972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  92.74 
 
 		 303 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1634  N-acetyl-D-glucosamine kinase  85.76 
 
 		 303 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  64.36 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  64.03 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  64.36 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  64.78 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  66.01 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  62.38 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2782  ROK family protein  62.38 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0831324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  53.16 
 
 		 302 aa  359  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  54.3 
 
 		 302 aa  352  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  53.16 
 
 		 302 aa  351  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  51.83 
 
 		 302 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  50.83 
 
 		 305 aa  321  8e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  39.13 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  42.7 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  39.46 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  40.84 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  41 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  40.52 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  40.52 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  38.28 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  38.8 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  40.52 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  40.52 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  40.52 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  41.75 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  40.2 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  40.52 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  40.52 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  38.87 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  40.8 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  38.87 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  40 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  38.87 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  40.59 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  38.87 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  38.87 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  39.27 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  40.67 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  41.45 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  39 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  39.6 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  40.8 
 
 		 308 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1332  ROK family protein  39.8 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  41.55 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  40.54 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2599  N-acetylglucosamine kinase  40.47 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  40.8 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  39.07 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  39.14 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  40 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  38.74 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  41.14 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  40.26 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  41.31 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  41.31 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  40.33 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  41.67 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  38.51 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  38.24 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  40.98 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  38.56 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  38.56 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  38.56 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  40.98 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2698  N-acetylglucosamine kinase  39.8 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  36.82 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  40 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  38.51 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  36.75 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  42.19 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  40.39 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  40.39 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  38.13 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  40.13 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  40.07 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  39.33 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  39.74 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  37.79 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  43.33 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  37.79 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  37.79 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  42.31 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  43.19 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  38.21 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  41.12 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  39.6 
 
 		 310 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  35.97 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  38.24 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>