More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1680 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0731  transcriptional regulator/sugar kinase  41 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149546  normal  0.155714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  35.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  36.46 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  34 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  32.42 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  29.8 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  30.3 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  29.8 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  33.9 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.94 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  26.16 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.49 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.1 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.62 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.57 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.16 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  28.15 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  27.81 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0921  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.57 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.19 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  26.4 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.97 
 
 		 393 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.91 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  25.17 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  25.17 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  30 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  25.5 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  24.68 
 
 		 396 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  25.74 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.71 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  25.5 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  29.58 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  25.83 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  28.03 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.58 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.49 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.1 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.36 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.36 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.42 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  26.76 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.73 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  25.57 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  28.99 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.3 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  27.92 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  24.67 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  24.83 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.52 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.52 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.44 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  26.76 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  25.93 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  24.59 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  26.76 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.63 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  26.13 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  25.42 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  24.92 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  31.46 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  31.46 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  27.88 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  24.28 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  24.6 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl497  glucose kinase  29.62 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl616  transcriptional regulator/sugar kinase  23.51 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  24.46 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  22.97 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  24.76 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  27.54 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  26.01 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  27.24 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  23.57 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  25.09 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.17 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  26.83 
 
 		 352 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  25.32 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  25.63 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  24.69 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  25.86 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  25.17 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  23.75 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  26.45 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>