More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0731 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0731  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149546  normal  0.155714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  33.77 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  33.44 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  32.3 
 
 		 298 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0921  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  29.55 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  29.74 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  30 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  28.86 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.37 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  30.34 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.43 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  29.01 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.1 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.09 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.52 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  28.47 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  24.6 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  26.57 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  25.5 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.82 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  26.48 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  25.17 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.19 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.39 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.39 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  26.26 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.77 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  25.83 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  27.48 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  27.15 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.65 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  28.1 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.43 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  25.45 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  25.17 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  25.17 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  26.03 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  25.84 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  25.24 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  25.9 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  30.43 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  30.43 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.24 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.73 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.14 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.51 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.39 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.39 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  27.97 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  25.96 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  24.83 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.21 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  24.84 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  28 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  26.69 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  25.42 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  27.57 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  28.1 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  25.74 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  28.29 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  25.75 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  26.74 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  25.44 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  27.48 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  25.75 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  25.75 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  24.15 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  23.99 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  26.18 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  24.48 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  24.26 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  27.67 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  25.56 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl616  transcriptional regulator/sugar kinase  29.85 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  28.51 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.33 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  23.81 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  25 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  24.48 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  24.48 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  21.36 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.55 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  21.58 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  25.93 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.18 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  27.56 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  25.39 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  21.27 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  28.86 
 
 		 381 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  23.89 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  23.99 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  24.14 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  24.9 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>