More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0418 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  100 
 
 
291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  29.1 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  28.43 
 
 
292 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  28.43 
 
 
292 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.72 
 
 
292 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  28.09 
 
 
292 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  28.28 
 
 
292 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.04 
 
 
292 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  28 
 
 
292 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  30.8 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  28.04 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  31.01 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  29.33 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  27.06 
 
 
293 aa  95.5  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.08 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  26.8 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.54 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  30.03 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  31.13 
 
 
283 aa  92.8  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.25 
 
 
311 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.67 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  23.13 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.95 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.95 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  29.84 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.39 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  27.72 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  26.69 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.5 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.9 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  25.16 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  25.16 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  23.53 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  26.47 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  24.5 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.98 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.57 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  22.29 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  23.32 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  26.21 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.25 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  21.58 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  21.5 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  24.91 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  24.91 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  25.93 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  24.91 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  24.43 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  27.04 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  26.51 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  28.14 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  23.3 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl013  transcriptional regulator/sugar kinase  26.21 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  25.51 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  26.27 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  21.02 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  24.18 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  23.08 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.5 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  24.18 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  26.25 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  26.25 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  24.6 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  27.64 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  24.6 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  24.92 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  26.52 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  24.18 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  24.18 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  24.18 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  26.36 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  26.38 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  24.18 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  25.32 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  25 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  25 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  24.17 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  25 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl616  transcriptional regulator/sugar kinase  27.33 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  24.7 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  25.67 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  23.53 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  23.79 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  26.96 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25.47 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  24.63 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  21.63 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  23.43 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  25.3 
 
 
317 aa  62.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  24.05 
 
 
373 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  22.65 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  24.92 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  25.56 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  24.92 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  24.14 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  23.45 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  25.67 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  23.26 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  24.92 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>