More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2663 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  100 
 
 
337 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  51.82 
 
 
306 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  48.07 
 
 
307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  47.21 
 
 
317 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  44.59 
 
 
321 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  47.37 
 
 
302 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  47.02 
 
 
302 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  47.02 
 
 
302 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  49.34 
 
 
304 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10663  sugar kinase  51.76 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.97302e-41  normal  0.432322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  45.85 
 
 
315 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7000  ROK family protein  48.26 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3653  glucokinase  42.14 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  37.09 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4996  glucose kinase  49.84 
 
 
313 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8557  glucose kinase  37.1 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.9 
 
 
315 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.9 
 
 
315 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  35.2 
 
 
307 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.68 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.56 
 
 
352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.91 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.84 
 
 
347 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  35.53 
 
 
321 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  32.8 
 
 
316 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.58 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.51 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.51 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  33.66 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.6 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.03 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.49 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  36.91 
 
 
312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.69 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.86 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  35.03 
 
 
363 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.22 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  35 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  37.74 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.66 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  33.94 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.15 
 
 
327 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.59 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.39 
 
 
389 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.87 
 
 
313 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  37.97 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.38 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.91 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  27.65 
 
 
292 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.65 
 
 
292 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  35.65 
 
 
319 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.65 
 
 
292 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.55 
 
 
322 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.79 
 
 
321 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  35.71 
 
 
290 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  35.71 
 
 
290 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  35.71 
 
 
290 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3392  ROK family protein  37.31 
 
 
329 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.83 
 
 
313 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.26 
 
 
315 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  25.94 
 
 
292 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  37.13 
 
 
323 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  34.19 
 
 
308 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  25.99 
 
 
292 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  32.58 
 
 
314 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.27 
 
 
292 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.24 
 
 
316 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  32.11 
 
 
315 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.6 
 
 
292 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  32.69 
 
 
311 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  35.05 
 
 
363 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  38.25 
 
 
429 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.96 
 
 
292 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.12 
 
 
325 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  33.44 
 
 
315 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  33.23 
 
 
306 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  32.92 
 
 
328 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.69 
 
 
306 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.59 
 
 
401 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.65 
 
 
400 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  36.62 
 
 
313 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  28.7 
 
 
318 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  33.65 
 
 
321 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  31.29 
 
 
292 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  25.6 
 
 
292 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  30.22 
 
 
478 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  33.57 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  36.25 
 
 
314 aa  99.4  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.96 
 
 
422 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.05 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.44 
 
 
420 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>