More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0813 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  100 
 
 		 299 aa  610  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.22 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  32.21 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  31.49 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.46 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.76 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.76 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.45 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.36 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  32.31 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  29.3 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.15 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.15 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  29.34 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.46 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.69 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.89 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.97 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.06 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.67 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.67 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  24.58 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.71 
 
 		 302 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.95 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.1 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  28.52 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  29.18 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.79 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.44 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.9 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.76 
 
 		 410 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.2 
 
 		 417 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  27.05 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.8 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2267  ROK family protein  30.46 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  34.07 
 
 		 354 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  25.36 
 
 		 389 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  24.22 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.6 
 
 		 434 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0649  ROK family protein  30.96 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.32 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.91 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  29.21 
 
 		 322 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.58 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  30.43 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.44 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  29.04 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  28.37 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  24.84 
 
 		 335 aa  92  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.67 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  34.31 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  30.84 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  22.93 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.57 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.08 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  28.52 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  23.4 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  29.32 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  27.72 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  22.22 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.3 
 
 		 402 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  26.03 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.85 
 
 		 422 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  23.25 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.88 
 
 		 405 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.69 
 
 		 406 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  25.47 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  22.22 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  29.37 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.63 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  27.85 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  23.08 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  29.61 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  23.08 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  29.41 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.44 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  28.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  31.41 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  28.32 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  29.02 
 
 		 381 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  23.27 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  31.79 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.3 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  23.77 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  26.92 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  26.64 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  23.08 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  21.71 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.25 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  26.86 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  30.56 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>