More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0649 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0649  ROK family protein  100 
 
 
325 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  47.35 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  52.84 
 
 
303 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  52.12 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  46.86 
 
 
306 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  48.51 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  46.25 
 
 
324 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  44.19 
 
 
319 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  37.19 
 
 
347 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  35.37 
 
 
320 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.58 
 
 
322 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.89 
 
 
311 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  38.02 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.97 
 
 
312 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.39 
 
 
323 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  33.96 
 
 
327 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.89 
 
 
298 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.99 
 
 
315 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  33.64 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.89 
 
 
315 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.89 
 
 
315 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.23 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.64 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.64 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.43 
 
 
297 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.43 
 
 
297 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  39.81 
 
 
326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.52 
 
 
315 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  31.29 
 
 
385 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  33.65 
 
 
321 aa  143  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.89 
 
 
342 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.64 
 
 
327 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.19 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.96 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.13 
 
 
303 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.18 
 
 
321 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.47 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.1 
 
 
299 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.01 
 
 
395 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  38.43 
 
 
297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.86 
 
 
325 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  31.78 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.71 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  33.98 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.39 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.85 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.69 
 
 
321 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  33.44 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  34.59 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.6 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.62 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.53 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  31.83 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.74 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  34.71 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.43 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.5 
 
 
316 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.88 
 
 
322 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  29.14 
 
 
291 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  33.44 
 
 
325 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.97 
 
 
314 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.97 
 
 
314 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  33.97 
 
 
323 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.38 
 
 
319 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.84 
 
 
396 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.26 
 
 
389 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  36.08 
 
 
317 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.68 
 
 
308 aa  122  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.57 
 
 
409 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.03 
 
 
410 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  33.12 
 
 
306 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  30.55 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  35.09 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  37.12 
 
 
363 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  31.49 
 
 
317 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  36.12 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.21 
 
 
399 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.57 
 
 
316 aa  119  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  36.34 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0466  ROK family protein  31.01 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  31.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.39 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.41 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  33.84 
 
 
315 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  33.98 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.02 
 
 
407 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2462  ROK family protein  32.4 
 
 
315 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2841  ROK family protein  32.4 
 
 
315 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.45 
 
 
428 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.67 
 
 
300 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  34.4 
 
 
405 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  30.57 
 
 
393 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.8 
 
 
396 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>