More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3041 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  100 
 
 		 354 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  64.19 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  59.35 
 
 		 325 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  61.76 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  52.81 
 
 		 314 aa  298  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  42.54 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  44.23 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  44.3 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  42.36 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  40.06 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  44.55 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  44.05 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  42.04 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  43.77 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  43.23 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  39.55 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  43.37 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  37.94 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  41.53 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  41.46 
 
 		 360 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  37.94 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  36.86 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  38.91 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  43.45 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  39.55 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  42.9 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  38.59 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  39.29 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  40.71 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  39.62 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  36.54 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  41.4 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  40.45 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  39.35 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.77 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.59 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.58 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.58 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.85 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.29 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  36.65 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  34.17 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.72 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.41 
 
 		 408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.23 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.3 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  34.8 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30.94 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.17 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.53 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.93 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.25 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.75 
 
 		 322 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.89 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.6 
 
 		 306 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.86 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.05 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  34.93 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.84 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.07 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  30.82 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.95 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.87 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.66 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  28.38 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  34.03 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  33.87 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  36.73 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  32.5 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.09 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  30.28 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.53 
 
 		 316 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  30.77 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  33.87 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.44 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  30.48 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  35.03 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.09 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.58 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  34.28 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30.06 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.12 
 
 		 396 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.94 
 
 		 434 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.54 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  30.86 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  31.79 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.43 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.9 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.23 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.98 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.98 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  29.62 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  28.44 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  28.21 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  33.02 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  27.71 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  34.29 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.94 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.94 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>