More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2267 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2267  ROK family protein  100 
 
 
300 aa  584  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  35.19 
 
 
314 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  35.36 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.71 
 
 
391 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.6 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.96 
 
 
396 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.3 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.3 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.09 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.71 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.76 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  34.63 
 
 
478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.69 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.43 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  30.34 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.82 
 
 
321 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.68 
 
 
300 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.55 
 
 
342 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  30.46 
 
 
299 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.19 
 
 
390 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  31.36 
 
 
332 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.57 
 
 
313 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.85 
 
 
327 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.09 
 
 
297 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  30.4 
 
 
308 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  31.08 
 
 
278 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.04 
 
 
298 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.99 
 
 
323 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.04 
 
 
302 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.22 
 
 
405 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.47 
 
 
302 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  32.42 
 
 
255 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.16 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.77 
 
 
409 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  31.14 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.71 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.71 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  37.67 
 
 
322 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.39 
 
 
320 aa  99  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  30.58 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.27 
 
 
434 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  34.46 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.31 
 
 
385 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.52 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.36 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  32.97 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.85 
 
 
405 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.64 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.76 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  24.91 
 
 
407 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.83 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.54 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.52 
 
 
401 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.3 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  31.56 
 
 
396 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.3 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  30.04 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  28.91 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.32 
 
 
401 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  31.91 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  29.59 
 
 
315 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.79 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  31.97 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.94 
 
 
402 aa  92.8  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  31.79 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  28.44 
 
 
410 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  33.95 
 
 
321 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  36.63 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  33.71 
 
 
329 aa  92  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.64 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.96 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.21 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  32.33 
 
 
425 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.27 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.01 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.54 
 
 
397 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  33.33 
 
 
425 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  32.42 
 
 
402 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  24.65 
 
 
317 aa  89  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.03 
 
 
387 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  31.76 
 
 
313 aa  89  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.68 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.13 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.86 
 
 
422 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  30.61 
 
 
321 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  32.29 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.12 
 
 
347 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  36.7 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.3 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  31.98 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>