More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6585 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  60 
 
 
276 aa  340  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  39.11 
 
 
312 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  33.82 
 
 
282 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  34.19 
 
 
280 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  34.19 
 
 
280 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  33.82 
 
 
280 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.71 
 
 
298 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.79 
 
 
319 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.17 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.97 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.97 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.86 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.77 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.99 
 
 
302 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.95 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  32.09 
 
 
305 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.05 
 
 
312 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.77 
 
 
408 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.77 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.8 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.32 
 
 
328 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.12 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  27.96 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.6 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.6 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.22 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  31.51 
 
 
306 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  28.32 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  26.64 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.66 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.6 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  27.85 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.08 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.57 
 
 
315 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.57 
 
 
315 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.42 
 
 
322 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.21 
 
 
313 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  27.24 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  27.99 
 
 
293 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.64 
 
 
292 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  28.07 
 
 
292 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.88 
 
 
292 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.03 
 
 
315 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  26 
 
 
332 aa  106  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  26.1 
 
 
298 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  27.96 
 
 
302 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  26.84 
 
 
308 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.66 
 
 
295 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  26.92 
 
 
333 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.3 
 
 
295 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  26.84 
 
 
314 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  26.84 
 
 
314 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.32 
 
 
386 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  25.81 
 
 
317 aa  102  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.57 
 
 
316 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  26.69 
 
 
384 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.68 
 
 
347 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.14 
 
 
405 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  30.19 
 
 
306 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  29.81 
 
 
324 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.7 
 
 
409 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.21 
 
 
420 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  28.72 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18441  ROK family protein  29.41 
 
 
304 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  28.57 
 
 
318 aa  99.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  26.06 
 
 
321 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  25.88 
 
 
372 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  24.2 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  26.98 
 
 
443 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.47 
 
 
434 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.14 
 
 
396 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  25.24 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.55 
 
 
321 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.51 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.1 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.68 
 
 
395 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.17 
 
 
401 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  29.9 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.28 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  27.27 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  26.06 
 
 
321 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  28.57 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  26.76 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  27.2 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  25.26 
 
 
389 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  28.88 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  26.77 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.45 
 
 
427 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.19 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  29.05 
 
 
332 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  28.9 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  28.3 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  28.9 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  27.04 
 
 
342 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
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NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  26.56 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
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NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  25.96 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  25.88 
 
 
319 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  27.6 
 
 
321 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_2804  ROK  30.1 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
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