More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4328 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  60.95 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  38.75 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  33.33 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  32.96 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  32.96 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  32.58 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.06 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.84 
 
 		 319 aa  142  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.71 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.36 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.36 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.8 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.87 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.87 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  28.38 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  27.63 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  27.96 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.32 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  29.35 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  29.03 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.6 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.6 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  29.82 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.69 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.02 
 
 		 386 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.53 
 
 		 332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.24 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.2 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  29.39 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.3 
 
 		 352 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.22 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.81 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.94 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.88 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  29.04 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.01 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  28.32 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  28.43 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.08 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  29.1 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  29.18 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  28.73 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  29.18 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  29.06 
 
 		 327 aa  99  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.47 
 
 		 342 aa  98.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
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NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.04 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.91 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  29.97 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  29.13 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.57 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  26.13 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.57 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.03 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  25.48 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  27.31 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.13 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  26.26 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.57 
 
 		 409 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  25.62 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  26.14 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  25.26 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  26.69 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  27.03 
 
 		 392 aa  93.2  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  29.81 
 
 		 306 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.21 
 
 		 443 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  26.06 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  24.75 
 
 		 321 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.23 
 
 		 389 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  25.87 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  24.52 
 
 		 335 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  28.03 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18441  ROK family protein  29.91 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  30.92 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  27.76 
 
 		 329 aa  91.3  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  27.24 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.02 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  24.58 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  29.92 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  27.18 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.74 
 
 		 401 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.82 
 
 		 397 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  29.9 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3719  D-allose kinase  22.87 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  24.29 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.48 
 
 		 398 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  25.65 
 
 		 420 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 		 406 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  26.8 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  24.92 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  24.03 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.47 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 		 406 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.11 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 		 406 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 		 406 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  23.49 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  23.49 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.59 
 
 		 410 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  26.32 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
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