More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1856 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  100 
 
 
316 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  46.84 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  49.84 
 
 
314 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  45.08 
 
 
314 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  50.47 
 
 
314 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  47.6 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  48.25 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  45.69 
 
 
315 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  41.59 
 
 
342 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  42.68 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  43.99 
 
 
323 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  46.47 
 
 
312 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  45.89 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  44.9 
 
 
320 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  43.22 
 
 
315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  43.49 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  44.44 
 
 
312 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  41.21 
 
 
313 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  43.17 
 
 
361 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  42.49 
 
 
313 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  42.14 
 
 
360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  42.31 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  44.94 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  38.03 
 
 
314 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  38.85 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  42.31 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  39.22 
 
 
314 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  41.35 
 
 
363 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  35.38 
 
 
320 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  42.32 
 
 
315 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  41.77 
 
 
330 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  39.94 
 
 
335 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  37.14 
 
 
313 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  39.43 
 
 
329 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  36.86 
 
 
354 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.91 
 
 
316 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.29 
 
 
322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  36 
 
 
316 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  33.44 
 
 
332 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.55 
 
 
312 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.33 
 
 
335 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.61 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  34.26 
 
 
322 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.41 
 
 
315 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.81 
 
 
321 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.54 
 
 
315 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.54 
 
 
315 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  34.98 
 
 
307 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  35.31 
 
 
316 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  31.75 
 
 
314 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  33.33 
 
 
313 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  34.15 
 
 
328 aa  152  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.72 
 
 
347 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  33.75 
 
 
332 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  34.62 
 
 
306 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.45 
 
 
312 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.29 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.03 
 
 
308 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.94 
 
 
317 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.57 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  31.99 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.54 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  30.7 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.65 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  34.18 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  31.63 
 
 
300 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.02 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.12 
 
 
321 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.75 
 
 
314 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.75 
 
 
314 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  33.13 
 
 
330 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.5 
 
 
328 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.11 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.51 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  32.81 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.81 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 
318 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  38.39 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  31.58 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  32.3 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  32.18 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  32.3 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  31.45 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.92 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  30.12 
 
 
327 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.33 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  33.96 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  31.89 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  31.01 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  32.08 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  34.38 
 
 
325 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>