More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2323 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  100 
 
 		 321 aa  631  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  97.05 
 
 		 305 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  90.1 
 
 		 305 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  70.71 
 
 		 313 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  68.51 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  70.37 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  59.87 
 
 		 299 aa  348  8e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  62.42 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  61.95 
 
 		 301 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  56.33 
 
 		 302 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  56 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  56 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  56 
 
 		 302 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  56 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  55 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  55 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  55 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  55.33 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  57.33 
 
 		 303 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  57.33 
 
 		 303 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  54.15 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  54.67 
 
 		 302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  54.67 
 
 		 302 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  54.33 
 
 		 302 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  54.33 
 
 		 302 aa  315  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  53.67 
 
 		 301 aa  315  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  54.33 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  54.33 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  51.89 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  60.94 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  54.33 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  55.67 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  53.54 
 
 		 313 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  57.86 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  54.97 
 
 		 312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  57.24 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  51.5 
 
 		 299 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  56.67 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  51.51 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  53.51 
 
 		 300 aa  291  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  59.46 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  55.37 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  57.38 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  52.35 
 
 		 301 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  52.17 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  51.84 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  51.84 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  51.84 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  51.68 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  51.17 
 
 		 307 aa  282  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  48.82 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  49.83 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  53.07 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  51.17 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  51.34 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  51.34 
 
 		 299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  50.83 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  55.52 
 
 		 282 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  49.02 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  49.02 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  49.02 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  48.69 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  51.33 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  52.67 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  53.72 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  46.98 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  49.19 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  49.19 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  48.52 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  49.19 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  48.86 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  51.34 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  44.41 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  43.52 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  55.03 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  40.13 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.33 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.33 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  40 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  42.52 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  41.55 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  39.2 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  37.29 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.33 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  42.2 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  43.33 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.33 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  39.74 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  35.33 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  35.67 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  37.5 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1634  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1335  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.33 
 
 		 303 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0173083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.33 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.33 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>