More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0351 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  72.11 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  50.85 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  45.39 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  45.16 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  42.42 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  40.4 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  41.22 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  45.45 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  43.38 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  42.33 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  41.18 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  41.18 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  41.18 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  47.12 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  46.64 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  45.79 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  42.62 
 
 		 304 aa  221  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  44.78 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  43.67 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  43.29 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  46.33 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  39.8 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  42.28 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  42.72 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  40.67 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  42.28 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  43 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  44.11 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  43.77 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  44.11 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  44.11 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  41 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  41 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  45.12 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  40.67 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  40.67 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  40.67 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  43.69 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  43.04 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  43.04 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  40.67 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  43.04 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  41.69 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  42.72 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  42.09 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  40.6 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  40.88 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  44.08 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  42.52 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  45.12 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  42.76 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  42.53 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  42.11 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  42.53 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  42.86 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  41.86 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  42.38 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  42.53 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  42.76 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  43.62 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  40.4 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2127  Rok family protein  45.12 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357191  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  41.06 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  38.41 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  44.63 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5716  ROK family protein  44.26 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2919  ROK family protein  43.73 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0770756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1583  ROK family protein  43.71 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.230527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.13 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.13 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  42.05 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  45.45 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  40.79 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  35.45 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  39.08 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  44.48 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.12 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  38.08 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  45.05 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  40.16 
 
 		 261 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  41.91 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2519  ROK family protein  40.26 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.892338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  34.56 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  35.57 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  43.96 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.54 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  35.41 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  36.4 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  34.78 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.78 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.78 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.78 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>