More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2127 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2127  Rok family protein  100 
 
 
311 aa  620  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357191  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  59.02 
 
 
307 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  61.95 
 
 
304 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2919  ROK family protein  62.67 
 
 
304 aa  323  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0770756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2519  ROK family protein  60.07 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.892338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  56.57 
 
 
298 aa  293  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1583  ROK family protein  47.71 
 
 
306 aa  258  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.230527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5716  ROK family protein  50.5 
 
 
299 aa  245  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838692  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  44.18 
 
 
291 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  47.81 
 
 
297 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  45.12 
 
 
304 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  44.67 
 
 
299 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  45.39 
 
 
289 aa  198  9e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  40.33 
 
 
302 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  39.47 
 
 
301 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  40.33 
 
 
302 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  40.33 
 
 
302 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  40.33 
 
 
302 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  40.33 
 
 
302 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  40.33 
 
 
331 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  40 
 
 
302 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  40 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  40 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  40.4 
 
 
313 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  39.34 
 
 
302 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  39.03 
 
 
326 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  38.69 
 
 
302 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  38.69 
 
 
302 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  38.66 
 
 
304 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  38.66 
 
 
304 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  38.66 
 
 
304 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  38.69 
 
 
302 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  40.72 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  38.94 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  38.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  40.66 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  40.58 
 
 
313 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  41.14 
 
 
307 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  40.66 
 
 
302 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  37.33 
 
 
299 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  39.74 
 
 
312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  36.81 
 
 
310 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  37.87 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  41.5 
 
 
312 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  39.4 
 
 
303 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  44.92 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  39.07 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  36.5 
 
 
307 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  38.82 
 
 
306 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  39.8 
 
 
300 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  38.94 
 
 
305 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  39.33 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  42.57 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  39.2 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  40 
 
 
298 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  39.46 
 
 
306 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  38 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  39.67 
 
 
298 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  39.67 
 
 
298 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  38.74 
 
 
306 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  39.67 
 
 
298 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  35.28 
 
 
306 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  36.94 
 
 
329 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  42.53 
 
 
299 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  36.77 
 
 
298 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  39.62 
 
 
261 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  39.2 
 
 
296 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  39.67 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  38.67 
 
 
310 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  37.82 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  37.82 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  37.12 
 
 
301 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  37.82 
 
 
306 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  37.74 
 
 
318 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  37.06 
 
 
306 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  37.22 
 
 
306 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  37.99 
 
 
305 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  37.99 
 
 
305 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  37.3 
 
 
305 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  37.79 
 
 
299 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  37.66 
 
 
305 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  42.11 
 
 
282 aa  149  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.48 
 
 
304 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  37.34 
 
 
305 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.48 
 
 
304 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  36.33 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  39.2 
 
 
300 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.9 
 
 
305 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  32.9 
 
 
302 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.54 
 
 
320 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.78 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  38.21 
 
 
301 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.03 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  40 
 
 
296 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.64 
 
 
303 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  37.33 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.7 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  34.53 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.92 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.53 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>