More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4078 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  100 
 
 
301 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  64.75 
 
 
297 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  57 
 
 
304 aa  347  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  61.3 
 
 
329 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  65.08 
 
 
306 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  59.8 
 
 
299 aa  343  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  56.12 
 
 
301 aa  334  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  59.4 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  55.78 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  55.96 
 
 
303 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  61.28 
 
 
318 aa  324  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  54 
 
 
302 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  54 
 
 
302 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  54 
 
 
302 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  54 
 
 
302 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  54 
 
 
302 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  58.84 
 
 
313 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  53.33 
 
 
302 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  54.82 
 
 
303 aa  322  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  53.64 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  53.64 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  53.33 
 
 
301 aa  318  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  60.81 
 
 
305 aa  318  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  53.31 
 
 
331 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  53.31 
 
 
302 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  53.31 
 
 
302 aa  316  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  58.53 
 
 
310 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  53.31 
 
 
302 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  56.29 
 
 
307 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  52.98 
 
 
302 aa  314  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  51.67 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  51.67 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  52.65 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  51.67 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  61.43 
 
 
282 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  59.46 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  57.29 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  59.12 
 
 
305 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  52.36 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  53.51 
 
 
303 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  57.77 
 
 
301 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  56.25 
 
 
306 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  53.16 
 
 
312 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  51.19 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  47.99 
 
 
299 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  49.83 
 
 
307 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  47.8 
 
 
301 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  47.28 
 
 
298 aa  271  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  53.85 
 
 
307 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  47.28 
 
 
326 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  49.15 
 
 
296 aa  268  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  50.17 
 
 
300 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  49.33 
 
 
301 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  49.49 
 
 
299 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  48.99 
 
 
296 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  52.31 
 
 
261 aa  265  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  55.18 
 
 
302 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  48.81 
 
 
298 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  48.81 
 
 
298 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  48.81 
 
 
298 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  48.47 
 
 
298 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  48.37 
 
 
305 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  48.37 
 
 
305 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  48.04 
 
 
305 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  48.84 
 
 
305 aa  258  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  48.04 
 
 
305 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  50.51 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  47.52 
 
 
306 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  47.52 
 
 
306 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  47.52 
 
 
306 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  47.56 
 
 
306 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  49.32 
 
 
300 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  54 
 
 
298 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  42.91 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  43.88 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  42.62 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.23 
 
 
304 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.23 
 
 
304 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.57 
 
 
306 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  44.93 
 
 
306 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  46.45 
 
 
312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.89 
 
 
303 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  41.55 
 
 
303 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.55 
 
 
303 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.55 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.55 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.55 
 
 
303 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  38.85 
 
 
302 aa  208  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.53 
 
 
302 aa  205  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.51 
 
 
302 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  42.67 
 
 
310 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  45.97 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.23 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.84 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2148  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.23 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  hitchhiker  0.000723972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.89 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1335  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.89 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0173083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.89 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  41.12 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  41.91 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>