More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1005 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  96.04 
 
 		 303 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  76.41 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  76.41 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  76.08 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  76.08 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  75.33 
 
 		 302 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  76.08 
 
 		 302 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  76.08 
 
 		 302 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  76.08 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  75.33 
 
 		 302 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  74.67 
 
 		 302 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  74.42 
 
 		 301 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  75.75 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  74.67 
 
 		 302 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  75 
 
 		 302 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  74.09 
 
 		 302 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  76.08 
 
 		 303 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  72.91 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  72.91 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  72.91 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  71.62 
 
 		 306 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  73.08 
 
 		 261 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  64.88 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  60.47 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  61.87 
 
 		 296 aa  364  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  62.88 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  60.4 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  60.47 
 
 		 299 aa  359  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  61.87 
 
 		 296 aa  358  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  61.36 
 
 		 305 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  61.13 
 
 		 301 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  60.06 
 
 		 305 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  59.74 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  59.74 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  60.52 
 
 		 306 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  60.52 
 
 		 306 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  59.74 
 
 		 305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  60.52 
 
 		 306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  60.45 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  59.2 
 
 		 298 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  58.86 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  58.86 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  58.86 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  57.72 
 
 		 310 aa  338  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  62.05 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  61.2 
 
 		 296 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  54.52 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  53.47 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  54.67 
 
 		 299 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  52.49 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  58 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  54.36 
 
 		 313 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  56.44 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  53.02 
 
 		 301 aa  309  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  52.51 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  55.96 
 
 		 301 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  56.33 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  56.71 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  57.33 
 
 		 321 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  52.35 
 
 		 312 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  57 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  56.67 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  54 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  50.31 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  46.84 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  49.5 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  53.33 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  52.33 
 
 		 318 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  49.16 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  49.84 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  45.64 
 
 		 306 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  42.42 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  50.67 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  52.84 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  41 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.33 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.4 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  41.53 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  39.07 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.07 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.07 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.07 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.07 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  43 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  39.16 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  41.22 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  40.64 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  38.94 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.21 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  42.67 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  41.95 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1332  ROK family protein  39 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.41 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  42.38 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.08 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  40.91 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  37.42 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>