More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3109 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  100 
 
 
303 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  74.83 
 
 
302 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  74.83 
 
 
302 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  74.83 
 
 
302 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  73.42 
 
 
302 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  74.83 
 
 
302 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  74.83 
 
 
302 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  74.5 
 
 
331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  74.5 
 
 
302 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  74.17 
 
 
302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  74.67 
 
 
302 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  74.33 
 
 
302 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  73.33 
 
 
302 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  73.09 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  74 
 
 
302 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  76.08 
 
 
303 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  75.75 
 
 
303 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  74 
 
 
302 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  76.82 
 
 
306 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  70.57 
 
 
304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  70.57 
 
 
304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  70.57 
 
 
304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  74.21 
 
 
261 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  64.21 
 
 
302 aa  384  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  61.2 
 
 
296 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  60.54 
 
 
296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  59.14 
 
 
299 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  59.27 
 
 
301 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  60.4 
 
 
300 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  59.22 
 
 
306 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  59.22 
 
 
306 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  59.22 
 
 
306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  59.49 
 
 
306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  60.07 
 
 
310 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  58.77 
 
 
305 aa  350  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  58.77 
 
 
305 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  58.44 
 
 
305 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  58.44 
 
 
305 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  58.12 
 
 
305 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  58.61 
 
 
301 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  58.47 
 
 
299 aa  346  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  57.81 
 
 
298 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  57.48 
 
 
298 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  57.48 
 
 
298 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  57.48 
 
 
298 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  61 
 
 
300 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  55.12 
 
 
304 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  61.2 
 
 
296 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  56 
 
 
299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  52.84 
 
 
298 aa  318  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  54.52 
 
 
313 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  57.67 
 
 
305 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  55.33 
 
 
310 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  54.97 
 
 
299 aa  309  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  53.69 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  52.51 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  55.67 
 
 
301 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  51.66 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  53.85 
 
 
297 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  56.38 
 
 
306 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  55.67 
 
 
321 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  50 
 
 
301 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  55.33 
 
 
305 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  50.99 
 
 
307 aa  289  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  50.93 
 
 
329 aa  288  8e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  52.63 
 
 
282 aa  279  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  47.99 
 
 
326 aa  278  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  53.51 
 
 
301 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  49.83 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  51.33 
 
 
318 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  45.64 
 
 
306 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  49.35 
 
 
312 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  43.52 
 
 
310 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  50.34 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  54.85 
 
 
298 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  40 
 
 
291 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42 
 
 
306 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.67 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.87 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.33 
 
 
304 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.4 
 
 
302 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  43.67 
 
 
304 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  43.14 
 
 
307 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  38.41 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.08 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.74 
 
 
302 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  39 
 
 
299 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.33 
 
 
303 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  40 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 
303 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 
303 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40 
 
 
303 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  42 
 
 
297 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  40.07 
 
 
289 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  40.4 
 
 
306 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  40.43 
 
 
312 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  38.46 
 
 
308 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2599  N-acetylglucosamine kinase  38.21 
 
 
308 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65292  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1911  hypothetical protein  54.72 
 
 
159 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>