More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2216 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  100 
 
 		 329 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  58.46 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  64.92 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  58.82 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  61.3 
 
 		 301 aa  338  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  55.66 
 
 		 304 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  59.38 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  53.7 
 
 		 301 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  53.56 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  51.54 
 
 		 302 aa  325  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  51.54 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  58.77 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  51.54 
 
 		 302 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  51.54 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  51.54 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  51.85 
 
 		 302 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  53.66 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  50.93 
 
 		 302 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  50.93 
 
 		 302 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  49.54 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  49.54 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  49.54 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  50.31 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  50.62 
 
 		 302 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  50.62 
 
 		 302 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  50.46 
 
 		 331 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  50.62 
 
 		 302 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  50.62 
 
 		 302 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  50.31 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  52.13 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  49.07 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  54.01 
 
 		 299 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  55.56 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  50.93 
 
 		 303 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  50.31 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  49.38 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  53.03 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  51.53 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  49.07 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  53.85 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  50.31 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  48.33 
 
 		 312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  50.31 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  51.54 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  50 
 
 		 296 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  49.23 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  46.46 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  53.07 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  48.62 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  52.45 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  48.15 
 
 		 298 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  48.77 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  49.23 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  47.53 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  47.53 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  47.53 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  48.5 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  48.5 
 
 		 305 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  48.95 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  48.65 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  48.65 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  48.2 
 
 		 305 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  48.2 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  48.65 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  48.92 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  47.59 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  43.83 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  49.69 
 
 		 296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  49.46 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  48.31 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  43.08 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  50 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  40.62 
 
 		 291 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  39.94 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  50.46 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.15 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.7 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  37.38 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.84 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.08 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  36.53 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.54 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.15 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  38.7 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  37.76 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.15 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.15 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  36.84 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  41.64 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  37.95 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.84 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.84 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.84 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  38.71 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  39.08 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  36.39 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.97 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  38.72 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1583  ROK family protein  37.98 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.230527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  39.33 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>