More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1583 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1583  ROK family protein  100 
 
 		 306 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.230527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5716  ROK family protein  57.95 
 
 		 299 aa  321  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  49.51 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  49.84 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  50.49 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2127  Rok family protein  47.71 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357191  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2919  ROK family protein  50.16 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0770756  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  45.51 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2519  ROK family protein  44.89 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.892338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  43 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  40.65 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  39.22 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  39.41 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  39.09 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  41.29 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  41.39 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  39.81 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  40.97 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  40.97 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  40.97 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  44.52 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  42.53 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  39.35 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  40.73 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  40 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  40.32 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  40.32 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  40.32 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  38.76 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  40.97 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  40 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  40 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  40 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  40 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  40 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  39.68 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  40 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  39.68 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  39.61 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  41.37 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  39.74 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  40.26 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  42.35 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  37.46 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  36.98 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  41.37 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  39.12 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  39.68 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  38.11 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  39.68 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  39.68 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  41.04 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  41.75 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  37.34 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  41.37 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  41.37 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  41.37 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  37.99 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  42.67 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  36.66 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  41.69 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  40.72 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  39.35 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  38.71 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  38.11 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  38.11 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  39.41 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  37.79 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  37.46 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  39.61 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  39.94 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  39.37 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  39.37 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  39.41 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  39.37 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  39.49 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  39.49 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  39.49 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  38.54 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  39.17 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  39.41 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  32.9 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  40.13 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  38.4 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  33.55 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  40.58 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.31 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  31.95 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.59 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.63 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  40.39 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.63 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.33 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.65 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.65 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.03 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  30.03 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.03 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.03 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>