More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1321 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  80.2 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  80.2 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  80.2 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  79.87 
 
 		 298 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  80.07 
 
 		 296 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  76.25 
 
 		 300 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  76 
 
 		 301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  74.83 
 
 		 299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  77.36 
 
 		 296 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  72.79 
 
 		 305 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  72.55 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  72.55 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  72.22 
 
 		 306 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  72.09 
 
 		 310 aa  434  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  78.72 
 
 		 296 aa  434  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  72.13 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  72.46 
 
 		 305 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  72.13 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  72.22 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  70.82 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  67.34 
 
 		 299 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  74.92 
 
 		 300 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  61.54 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  59.93 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  59.6 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  59.6 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  59.6 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  59.6 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  59.6 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  59.6 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  59.27 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  59.87 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  59.53 
 
 		 302 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  59.53 
 
 		 302 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  59.87 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  59.2 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  59.87 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  59.53 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  59.87 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  59.87 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  60.73 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  60.8 
 
 		 303 aa  362  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  57.14 
 
 		 302 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  58.61 
 
 		 303 aa  355  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  58.88 
 
 		 306 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  53.85 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  61.51 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  52.54 
 
 		 313 aa  315  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  54.52 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  53.51 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  54.52 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  52.03 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  51.35 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  50.68 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  47.8 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  50.51 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  51.35 
 
 		 297 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  51.69 
 
 		 310 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  53.38 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  49.07 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  51.68 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  48.52 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  47.12 
 
 		 312 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  47.97 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  50.33 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  51.17 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  51.17 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  47.8 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  50.71 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  49.16 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  46.13 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  51.36 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  45.67 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  43.1 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  41.08 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.14 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.14 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.87 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.13 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.14 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  39.6 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  39.14 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.14 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.82 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.82 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  43.43 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  38.33 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.46 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.8 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  37.34 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  42.09 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.79 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  37.12 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2782  ROK family protein  39.46 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0831324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  40.47 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  37.37 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  38.38 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  38.61 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>