More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0313 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  99.6 
 
 		 302 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  99.6 
 
 		 302 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  99.6 
 
 		 302 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  98.81 
 
 		 302 aa  510  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  99.21 
 
 		 331 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  98.81 
 
 		 302 aa  510  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  99.21 
 
 		 302 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  98.41 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  90.48 
 
 		 301 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  88.49 
 
 		 302 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  88.89 
 
 		 302 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  88.1 
 
 		 302 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  88.49 
 
 		 302 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  88.1 
 
 		 302 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  76.19 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  73.08 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  71.15 
 
 		 303 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  74.21 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  67.06 
 
 		 304 aa  360  9e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  67.06 
 
 		 304 aa  360  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  67.06 
 
 		 304 aa  360  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  71.43 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  61.92 
 
 		 302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  61.51 
 
 		 301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  60 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  61.51 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  61.11 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  62.3 
 
 		 296 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  57.71 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  59.85 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  59.92 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  59.46 
 
 		 305 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  59.46 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  59.07 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  59.13 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  59.13 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  59.52 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  59.13 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  59.46 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  59.23 
 
 		 306 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  59.23 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  59.23 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  58.57 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  62.3 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  57.14 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  58.46 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  54.76 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  60.08 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  55.16 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  54.94 
 
 		 299 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  56.92 
 
 		 306 aa  268  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  54.12 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  56.54 
 
 		 299 aa  262  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  51.15 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  50.77 
 
 		 312 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  55.34 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  55.56 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  51.59 
 
 		 298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  52.67 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  47.84 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  52.67 
 
 		 305 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  55.95 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  51.78 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  52.12 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  50.78 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  53.97 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  50 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  49.46 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  50.98 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  53.02 
 
 		 282 aa  211  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  52.59 
 
 		 302 aa  208  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  38.65 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  40.08 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.61 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.69 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  42.31 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.31 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.31 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.31 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  52.59 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.31 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  39.37 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.92 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  42.29 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.76 
 
 		 306 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.53 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  38.52 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.98 
 
 		 302 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  42.91 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  41.04 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  41.96 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  36.05 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  37.08 
 
 		 304 aa  161  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.43 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1576  ROK family protein  39.44 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.47 
 
 		 302 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  37.65 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2782  ROK family protein  39.92 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0831324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1634  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.38 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>