More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3816 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  49.17 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  46.31 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  43.97 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  42.09 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  43.96 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  43.96 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  43.96 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  43.96 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  43.96 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  43.96 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  45.61 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.28 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.61 
 
 		 306 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.28 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2599  N-acetylglucosamine kinase  45.27 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2698  N-acetylglucosamine kinase  46.28 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1332  ROK family protein  44.78 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.27 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2782  ROK family protein  44.63 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0831324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  39.53 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  42.62 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.8 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.94 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  43.29 
 
 		 304 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.27 
 
 		 302 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  42.03 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  38.94 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  47.46 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  39.87 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  39.53 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  41.14 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  40.47 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  40.47 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  41.72 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  39.53 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  39.53 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  39.53 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  41.72 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  41.72 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  41.72 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  40.13 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  41.72 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1634  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.62 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  40.13 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  39.8 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  41.14 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  41.39 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  41.39 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  41.39 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  41.02 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  41.36 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  41.69 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1335  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.62 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0173083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.62 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  38.98 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.62 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.28 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  46.1 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2148  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.28 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  hitchhiker  0.000723972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  39.07 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  39.4 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  41.45 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  40.8 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  42.03 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  43.73 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  40.2 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  43.14 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  43.39 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  41.02 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  41.36 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  43.05 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  38.98 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  43.39 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  40.68 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  36.49 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  36.95 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  40.4 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  37.97 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  40 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  40 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  39.66 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  40 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  39.86 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  39.75 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  42.29 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  41.5 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  37.97 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  41.18 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  41.18 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  41.5 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  43.07 
 
 		 282 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  39.27 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  39.27 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  37.63 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  36.61 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  39.27 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  38.8 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  42.03 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  38.76 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>