More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1197 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  100 
 
 		 335 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2698  N-acetylglucosamine kinase  60.38 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2599  N-acetylglucosamine kinase  59.94 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  59.94 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  42.71 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.16 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.16 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  40.84 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.84 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.84 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.84 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.46 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  40.65 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.26 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.26 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  42.31 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  38.19 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1332  ROK family protein  40.84 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.16 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1335  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.16 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0173083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2148  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.16 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  hitchhiker  0.000723972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.84 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.84 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  35.69 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.73 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  34.82 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1634  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.23 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  35.26 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2782  ROK family protein  39.55 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0831324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  37.62 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  37.99 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  34.19 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  39.87 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  35.5 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  39.13 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  34.19 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  38.66 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  36.79 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  35.44 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  36.1 
 
 		 299 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  41.1 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  35.44 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  35.87 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  35.13 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  37.79 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  35.13 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  36.25 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  35.37 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  35.26 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  34.08 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  36.89 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  37.5 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  37.22 
 
 		 296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  37.18 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  33.87 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  39.09 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  38.71 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  36.86 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  34.92 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  34.29 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  33.97 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  34.73 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  33.97 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  35.92 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  33.65 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  33.65 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  35.6 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  35.6 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  33.65 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  35.6 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  33.65 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  34.6 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  36.93 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  33.65 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  34.95 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  33.33 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  34.58 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  34.94 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  35.16 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  34.3 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  36.57 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  30.84 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  36.57 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  33.12 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  33.12 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  33.12 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  35.53 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  35.53 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  34.3 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  33.87 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  34.62 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  35.22 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  36.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  33.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  36.59 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  36.59 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  37.54 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  35.11 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  35.31 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  36.28 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>