More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0197 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 313 aa  639    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  52.26 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  38.05 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  38.05 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  42.07 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  42.07 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  34.78 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  34.01 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  31.72 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  31.58 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  33.56 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  33.79 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  34.8 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  32.41 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  33.22 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  33.22 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  33.22 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  33.7 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  32.41 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  31.85 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  31.67 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  31.85 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  30.9 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  30.27 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  31.47 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  26.43 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.2 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.67 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.49 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.57 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  27.89 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  29.74 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.32 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.44 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  28.3 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.59 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30 
 
 		 393 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.18 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  26.54 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.42 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  27.04 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.55 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.42 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.55 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.1 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  28.09 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.41 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.55 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  28.48 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  31.06 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  29.25 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  31.97 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  26.47 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  26.18 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  25.75 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.93 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  27.53 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  25.74 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  25.55 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.95 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  29.21 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  26.38 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  24.34 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  31.97 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  25.44 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl013  transcriptional regulator/sugar kinase  28.21 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  30.42 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  28.66 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.51 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0921  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  26.28 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  29.61 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  29.74 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  29.74 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  28.35 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.43 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.31 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.45 
 
 		 393 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  27.95 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  26.94 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.6 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.39 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  26.8 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  25.77 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>