More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
318 aa  596  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  43.73 
 
 
329 aa  222  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  42.27 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  37.42 
 
 
316 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  41.95 
 
 
314 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3392  ROK family protein  43.45 
 
 
329 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  39.23 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0183  ROK family protein  41.69 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  35.08 
 
 
322 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2121  ROK family protein  42.12 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  35.87 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.82 
 
 
298 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.87 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.87 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.77 
 
 
313 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  32.7 
 
 
308 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.65 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.51 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.7 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.97 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.5 
 
 
352 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.38 
 
 
335 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.69 
 
 
321 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  36.73 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  34.89 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  30.21 
 
 
332 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  37.7 
 
 
306 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  36.89 
 
 
317 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  35.87 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.86 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.75 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.54 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.57 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.51 
 
 
311 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  36.33 
 
 
315 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.17 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  34.8 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.88 
 
 
315 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.88 
 
 
315 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  34.08 
 
 
321 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  35.78 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.71 
 
 
342 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  26.46 
 
 
313 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.88 
 
 
320 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  25 
 
 
295 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.19 
 
 
316 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.11 
 
 
303 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.94 
 
 
322 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  33.46 
 
 
314 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  32.81 
 
 
306 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.4 
 
 
406 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  24.92 
 
 
292 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  32.47 
 
 
303 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  31.44 
 
 
335 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  25.25 
 
 
292 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  25 
 
 
292 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.78 
 
 
303 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  32.9 
 
 
314 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.72 
 
 
297 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  24.52 
 
 
283 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  36.33 
 
 
321 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  31.1 
 
 
334 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  38.89 
 
 
313 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  24.92 
 
 
292 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  24.68 
 
 
295 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  24.58 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  24.58 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  32.92 
 
 
389 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  30.89 
 
 
402 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.32 
 
 
302 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.3 
 
 
390 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  33.33 
 
 
340 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  32.19 
 
 
305 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  31.45 
 
 
336 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.09 
 
 
315 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  24.34 
 
 
292 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  36.8 
 
 
400 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  35.25 
 
 
392 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.46 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  31.27 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  31.93 
 
 
332 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  35.29 
 
 
395 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  28.76 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  40.87 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  36.83 
 
 
320 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  34.45 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.54 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  34.47 
 
 
420 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  36.61 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.64 
 
 
408 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  34.77 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  33.78 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  32.2 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  23.59 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.96 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.05 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  29.38 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  28.72 
 
 
478 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0438  ROK family protein  40.58 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.43 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>