More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0273 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  100 
 
 
361 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  75.39 
 
 
342 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  64.8 
 
 
360 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  63.69 
 
 
363 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  57.1 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  58.33 
 
 
323 aa  326  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  57.64 
 
 
315 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  62.26 
 
 
363 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  50.8 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  51.76 
 
 
315 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  53.53 
 
 
313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  56.87 
 
 
314 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  54.17 
 
 
314 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  56.45 
 
 
312 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  53.67 
 
 
314 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  54.31 
 
 
313 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  52.72 
 
 
314 aa  285  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  52.48 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  54.49 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  50.31 
 
 
325 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  52.72 
 
 
335 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  52.08 
 
 
320 aa  279  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  50.64 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  51.28 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  54.92 
 
 
315 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  53.85 
 
 
329 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  56.01 
 
 
315 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  54.26 
 
 
315 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  53.65 
 
 
315 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  44.74 
 
 
314 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  44.82 
 
 
314 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  47.57 
 
 
313 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  43.77 
 
 
354 aa  225  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  43.17 
 
 
316 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  39.24 
 
 
320 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  38.73 
 
 
322 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  38.32 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  45.28 
 
 
319 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  36.42 
 
 
312 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  36.2 
 
 
323 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  39.81 
 
 
318 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.5 
 
 
315 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  32.9 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  37.46 
 
 
312 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  36.96 
 
 
303 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.81 
 
 
317 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  36.96 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.65 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.65 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  38.46 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  37.62 
 
 
297 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  37.62 
 
 
297 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  37.85 
 
 
316 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  42.22 
 
 
325 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  35.8 
 
 
323 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  34.73 
 
 
311 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  38.87 
 
 
317 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  36.22 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  34.91 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.83 
 
 
321 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  40.06 
 
 
336 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  34.17 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  34.38 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35.98 
 
 
335 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  36.57 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  39.37 
 
 
334 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  34.28 
 
 
302 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  36.31 
 
 
303 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  40.25 
 
 
313 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  32.9 
 
 
313 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  36 
 
 
322 aa  159  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  31.95 
 
 
400 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.75 
 
 
316 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  37.7 
 
 
302 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  33.92 
 
 
396 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  35.69 
 
 
319 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  33.97 
 
 
300 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  36.56 
 
 
318 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  34.8 
 
 
315 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  35.91 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  35.42 
 
 
323 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.44 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.44 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  31.68 
 
 
321 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.18 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.64 
 
 
408 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.59 
 
 
318 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.49 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.01 
 
 
299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  37.65 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.23 
 
 
409 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.79 
 
 
306 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  33.2 
 
 
396 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  31.4 
 
 
402 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>