More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1825 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  72.03 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  62.5 
 
 
315 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  59.62 
 
 
342 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  59.11 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  60.25 
 
 
360 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  58.2 
 
 
313 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  60.65 
 
 
314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  57.56 
 
 
363 aa  318  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  59.03 
 
 
314 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  56.13 
 
 
313 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  58.33 
 
 
361 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  53.38 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  55.66 
 
 
363 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  57.56 
 
 
312 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  53.7 
 
 
314 aa  295  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  56.31 
 
 
312 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  58.47 
 
 
315 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  57.51 
 
 
315 aa  289  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  54.02 
 
 
314 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  56.59 
 
 
315 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  54.19 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  56.91 
 
 
315 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  53.03 
 
 
330 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  53.05 
 
 
320 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  54.98 
 
 
329 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  52.58 
 
 
313 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  47.27 
 
 
325 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  44 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  43.99 
 
 
316 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  50.16 
 
 
335 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  42.09 
 
 
314 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  44.34 
 
 
313 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  43.63 
 
 
354 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  38.61 
 
 
320 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  34.94 
 
 
312 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  40.38 
 
 
315 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  35.46 
 
 
312 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35.42 
 
 
322 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  38.44 
 
 
347 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  45.08 
 
 
319 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  34.84 
 
 
316 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  41.72 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  36.22 
 
 
316 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  39.29 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  44.14 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  34.62 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  33.44 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.59 
 
 
315 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.59 
 
 
315 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  38.63 
 
 
340 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  36.48 
 
 
315 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  37.54 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  37.79 
 
 
321 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.29 
 
 
317 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.65 
 
 
318 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  39.74 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  35.13 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  40.51 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  37.62 
 
 
302 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  38.49 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.85 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.63 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  37.34 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  38.78 
 
 
314 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  38.78 
 
 
314 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.8 
 
 
299 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  35.96 
 
 
327 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  35.24 
 
 
322 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  35.24 
 
 
327 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  34.81 
 
 
303 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  36.39 
 
 
328 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  33.86 
 
 
321 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.87 
 
 
319 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.71 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  35.78 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.65 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  41.03 
 
 
306 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  35.87 
 
 
409 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.85 
 
 
298 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  35.69 
 
 
333 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  35.09 
 
 
322 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  40.58 
 
 
313 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.48 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  34.89 
 
 
314 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  35.94 
 
 
318 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  36.65 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  41.21 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.44 
 
 
395 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  35.51 
 
 
335 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.62 
 
 
300 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  41.48 
 
 
302 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.107325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>