More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2895 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  35.46 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.88 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.54 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  32.15 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  32.27 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.55 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.55 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.77 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.44 
 
 		 302 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.97 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.17 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  36.03 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  32.43 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.91 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.42 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.99 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  35.91 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.88 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.43 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  36.02 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.38 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  31.37 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.55 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.45 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.59 
 
 		 400 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.8 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30.86 
 
 		 322 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  32.96 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  34.66 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.39 
 
 		 389 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.75 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  29.87 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32.34 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32.34 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33.11 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.87 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.85 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  35.77 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  29.35 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.67 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.9 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  35.02 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.25 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.67 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.9 
 
 		 396 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  35.78 
 
 		 357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.13 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.89 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  32.41 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.53 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  34.92 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  30.19 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  33.12 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  37.22 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  30.19 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.44 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  37.76 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.42 
 
 		 386 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.08 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  33.33 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.94 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  29.41 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  29.87 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.16 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.39 
 
 		 387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.8 
 
 		 390 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  33.33 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.16 
 
 		 391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  32.95 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.64 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.8 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  33.1 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  33.55 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  35.32 
 
 		 403 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  31.89 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  30.56 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.46 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  38.61 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.8 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  33.67 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.95 
 
 		 418 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.42 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  32.5 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  33.33 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.83 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  36.24 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.07 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.8 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  31.97 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.23 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.41 
 
 		 434 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.95 
 
 		 389 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.94 
 
 		 405 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  27.21 
 
 		 406 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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