More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3170 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  100 
 
 
314 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  85.58 
 
 
312 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  43.81 
 
 
316 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  43.57 
 
 
322 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  34.5 
 
 
315 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  34.5 
 
 
315 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  37.82 
 
 
317 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  35.35 
 
 
315 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  40.32 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  38.68 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  40.95 
 
 
352 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  43.4 
 
 
318 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  33.97 
 
 
312 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  37.06 
 
 
328 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35.58 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.33 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  37.74 
 
 
342 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  35.53 
 
 
318 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  38.17 
 
 
313 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.57 
 
 
321 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  35.78 
 
 
313 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  40.26 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  39.49 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  37.62 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  39.81 
 
 
340 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.62 
 
 
315 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  34.52 
 
 
308 aa  162  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  32.18 
 
 
320 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  41.32 
 
 
363 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  41.27 
 
 
363 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.76 
 
 
312 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  38.61 
 
 
325 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  41.9 
 
 
323 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  38.05 
 
 
315 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  39.17 
 
 
401 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  37.66 
 
 
315 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  38.69 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  34.81 
 
 
335 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.87 
 
 
321 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.97 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  40.88 
 
 
314 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  39.56 
 
 
360 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  36.3 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.42 
 
 
319 aa  152  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  36.13 
 
 
336 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  36.16 
 
 
302 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.22 
 
 
334 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.48 
 
 
303 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.62 
 
 
347 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  34.92 
 
 
316 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35.37 
 
 
335 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.18 
 
 
300 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  36.59 
 
 
317 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  35.96 
 
 
310 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  35.21 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.36 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  38.99 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.95 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  37.62 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  34.47 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  33.12 
 
 
414 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30.91 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  34.19 
 
 
314 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.91 
 
 
314 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  34.19 
 
 
314 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32.18 
 
 
297 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  36.04 
 
 
315 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  37.94 
 
 
306 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32.18 
 
 
297 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.49 
 
 
302 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  40.63 
 
 
329 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  39.55 
 
 
319 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.89 
 
 
327 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  39.74 
 
 
315 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  35.9 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  38.59 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  37.14 
 
 
314 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  36.22 
 
 
408 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  38.8 
 
 
312 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.96 
 
 
327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.96 
 
 
327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  37.54 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  38.44 
 
 
318 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.41 
 
 
311 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  38.05 
 
 
315 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  39.63 
 
 
325 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.85 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.9 
 
 
313 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  39.69 
 
 
361 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  36.83 
 
 
324 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  35.78 
 
 
336 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  37.38 
 
 
313 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>