More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1033 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  100 
 
 
315 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  62.54 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  67.73 
 
 
315 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  57.83 
 
 
352 aa  342  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  59.68 
 
 
314 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  57.78 
 
 
313 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  57.51 
 
 
323 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  53.65 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  56.51 
 
 
314 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  56.19 
 
 
312 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  56.01 
 
 
361 aa  285  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  49.37 
 
 
314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  54.23 
 
 
360 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  53.18 
 
 
363 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  50.16 
 
 
315 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  53.05 
 
 
312 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  51.91 
 
 
320 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  50.96 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  49.21 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  53.77 
 
 
315 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  50.8 
 
 
363 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  51.6 
 
 
329 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  48.56 
 
 
314 aa  255  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  50.16 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  46.47 
 
 
325 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  49.04 
 
 
311 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  52.53 
 
 
315 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  50.32 
 
 
330 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  43.95 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  46.43 
 
 
313 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  41.23 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  41.78 
 
 
314 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  39.69 
 
 
320 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  38.22 
 
 
312 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  43.77 
 
 
354 aa  208  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  43.53 
 
 
335 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  39.17 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  40.26 
 
 
315 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  38.06 
 
 
322 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  38.84 
 
 
347 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  42.12 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  36.42 
 
 
323 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  35.58 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.59 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  37.42 
 
 
303 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  37.89 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  37.89 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  35.66 
 
 
316 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  38.89 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  40.57 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.23 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  38.73 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  36.93 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.56 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.56 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  36.39 
 
 
316 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  33.54 
 
 
318 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  35.03 
 
 
319 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  30.97 
 
 
407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  36.05 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  39.88 
 
 
340 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  35.35 
 
 
321 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  35.94 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  35.94 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  30.82 
 
 
313 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  40.06 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  39.56 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.78 
 
 
315 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  36.66 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  36.66 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.09 
 
 
300 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  36.28 
 
 
323 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30.23 
 
 
400 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  33.23 
 
 
321 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.28 
 
 
328 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.01 
 
 
408 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  36.25 
 
 
332 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  39.26 
 
 
332 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  30.38 
 
 
325 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  31.03 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.08 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  37.15 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  37.34 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  33.54 
 
 
325 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.08 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  34.62 
 
 
311 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.02 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.75 
 
 
409 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.48 
 
 
395 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.19 
 
 
306 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>